Detalhe da pesquisa
1.
Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes.
Cell;
185(20): 3689-3704.e21, 2022 09 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36179666
2.
The Translational Landscape of the Human Heart.
Cell;
178(1): 242-260.e29, 2019 06 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31155234
3.
Induction of kidney-related gene programs through co-option of SALL1 in mole ovotestes.
Development;
150(17)2023 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37519269
4.
RIF1 and KAP1 differentially regulate the choice of inactive versus active X chromosomes.
EMBO J;
40(24): e105862, 2021 12 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34786738
5.
Position effects at the FGF8 locus are associated with femoral hypoplasia.
Am J Hum Genet;
108(9): 1725-1734, 2021 09 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34433009
6.
IsoTools: a flexible workflow for long-read transcriptome sequencing analysis.
Bioinformatics;
39(6)2023 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37267159
7.
CENTRE: a gradient boosting algorithm for Cell-type-specific ENhancer-Target pREdiction.
Bioinformatics;
39(11)2023 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37982748
8.
Prediction of protein-protein interactions using sequences of intrinsically disordered regions.
Proteins;
91(7): 980-990, 2023 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36908253
9.
Hi-C Identifies Complex Genomic Rearrangements and TAD-Shuffling in Developmental Diseases.
Am J Hum Genet;
106(6): 872-884, 2020 06 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32470376
10.
Conserved DNA sequence features underlie pervasive RNA polymerase pausing.
Nucleic Acids Res;
49(8): 4402-4420, 2021 05 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33788942
11.
Assessing genome-wide dynamic changes in enhancer activity during early mESC differentiation by FAIRE-STARR-seq.
Nucleic Acids Res;
49(21): 12178-12195, 2021 12 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34850108
12.
SVIM-asm: structural variant detection from haploid and diploid genome assemblies.
Bioinformatics;
36(22-23): 5519-5521, 2021 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33346817
13.
ISCB Honors 2021 Award Recipients Peer Bork, Barbara Engelhardt, Ben Raphael, Teresa Attwood.
Bioinformatics;
37(Suppl_1): i1-i6, 2021 07 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34252962
14.
Formation of new chromatin domains determines pathogenicity of genomic duplications.
Nature;
538(7624): 265-269, 2016 Oct 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27706140
15.
Preformed chromatin topology assists transcriptional robustness of Shh during limb development.
Proc Natl Acad Sci U S A;
116(25): 12390-12399, 2019 06 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31147463
16.
Ranbow: A fast and accurate method for polyploid haplotype reconstruction.
PLoS Comput Biol;
16(5): e1007843, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32469863
17.
Genome-wide kinase-chromatin interactions reveal the regulatory network of ERK signaling in human embryonic stem cells.
Mol Cell;
50(6): 844-55, 2013 Jun 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-23727019
18.
Synthetic STARR-seq reveals how DNA shape and sequence modulate transcriptional output and noise.
PLoS Genet;
14(11): e1007793, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30427832
19.
Characterization of hundreds of regulatory landscapes in developing limbs reveals two regimes of chromatin folding.
Genome Res;
27(2): 223-233, 2017 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-27923844
20.
SVIM: structural variant identification using mapped long reads.
Bioinformatics;
35(17): 2907-2915, 2019 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30668829